微生物ゲノムの取り扱いが簡単
- ソフト名 : Epi-Gene
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Epi-Gene 詳細説明
EPI遺伝子は、全ゲノムを3つのカテゴリーのコア、アクセサリーおよびユニークな遺伝子にクラスター化することができます。遺伝子の欠如と存在に基づいて、2種類のPanmatrixes（i）二元Panmatrixを構築することができます。（ii）パンマトリックスシーケンスのアイデンティティに基づく。進化的な関係をさらに説明するために、バイナリパンマトリックスがUPMGAツリーとヒートマップを構築するために使用されます。シーケンスIDに基づくPANマトリックスは、さらなる定量分析に使用することができる。このパッケージはWindowsオペレーティングシステムでのみ機能できます。